造成这种混乱状况的原因，主要是中小企业典型的管理模式是所有权与经营权的高度统一，企业的投资者就是经营者，缺乏有效的制约措施；中小企业的管理者的管理思想落后，管理能力较差，忽视财务制度的严肃性和强制性，普遍缺乏高素质的财务管理人员，企业财务基础薄弱，使得企业的财务报表和财务分析不具有可信度，失去了财务管理的意义和作用，既不利于企业在筹资活动中取得银行等金融机构或其他投资机构的信任，获得资金的支持，也不利于企业在投资活动中根据企业真实的财务状况作出正确的投资分析和决策，获得投资收益，更不利于企业对日常营运资金的严格管理，总的来说，就不利于企业的长远发展。
资金短缺现象十分严重。清华大学高端培训班中小企业自身也存在很多问题，导致筹集资金的困难。首先是企业的信用障碍问题。从经济交易角度来看，良好的信用是经济交易顺利进行的基础，也是一个社会经济赖以繁荣发展的基础。经济交易过程中信用的缺失，一方面源于我国长期公有制条件下的计划经济体制淡化了人们之间进行经济交易所必须具有的信用意识；另一方面，在进行市场经济体制改革的初期，又忽视了信用问题对整个经济发展的重要性，至今还没有形成一种完善的、适合我国市场经济发展的社会信用制度。
其次，我国的中小企业存在一定的产权障碍，像城镇国有中小企业和集体中小企业，这些企业多数是由地方政府出面，以财政出一点、主管部门出一点、地方上效益好的企业出一点等所谓出资入股的方式建立起来的，有的乡镇企业或村办企业是通过农民集资的方式建立起来的。这些企业在建立的初期并没有确立明确的产权关系。